学校位于厦门市同安区内厝镇上塘村，创办于1993年8月。原校名为“福建省同安第十九中学”，1997年8月同安县撤县改区后，更名为“厦门市同安第十九中学”。1998年8月升格为普通完全中学。为了适应2002年厦门市基本普及高中教育发展的需要，1998年7月8日，厦门市人民政府下文（厦府[1998]综068号）批复，同意学校升格为普通完全中学。为适应构建“大厦门”构想，厦门市人民政府于2002年9月11日下文（厦府[2002]231号）批复，同意对同安区所辖中学进行更名，“厦门市同安第十九中学”也相应更名为“厦门市内厝中学”。2006年2月，学校通过省三级达标学校验收，步入省重点中学行列，学校是福建省67所高中新课程实验样本校之一。